Senoji Šventosios koplyčia buvo pastatyta maždaug 2 km atstumu nuo gyvenvietės centro apie 1930 m. Ji pavadinta „Stella Maris“ – kas reiškia Marija, Jūrų Žvaigždė. Pavadinimą suteikė ją ir pastatęs kunigas Jurgis Galdikas. Koplyčia statyta kaip laikina bažnyčia, kol maldos namai bus pastatyti pačioje Šventojoje.
1991 m. suprojektuota didelė bažnyčia su bokštu, kuris nukreiptas į jūrą. Bendras bažnyčios aukštis iki kryžiaus – 62 metrai, projekto autoriai – R. Krištapavičius ir G. Aperavičius. Pagal pirmosios koplyčios pavadinimą suteiktas ir vardas pačiai bažnyčiai. Statybos vykdytos nuo 1995 iki 2003 m., o vidaus įrengimas tęsėsi ir toliau.