Statytas XIX a. antroje pusėje dvaro teritorijoje, manoma, jog vietoje čia anksčiau stovėjusio tos pačios paskirties medinio pastato. Magazinas – buvęs grūdų sandėlys, po karo naudotas kaip Rajkoopsąjungos sandėlis, vėliau – kaip paminklų dirbtuvės. Pasakojama, kad anksčiau čia vykdavę ir šokiai. Magazinu dabar rūpinasi Sedos kultūros centas.